List of applications/Science (Русский)
Contents
Наука
Научные документы
Смотрите основной раздел: Научные документы.
Математика
Калькуляторы
Дополнительную информацию смотрите в Википедии: Сравнение программ-калькуляторов.
- bc — Интерактивный интерпретатор Си-подобного языка, позволяет выполнять вычисления с произвольно заданной точностью
- calc — Консольный калькулятор, позволяет выполнять вычисления с произвольно заданной точностью
- Extcalc — Основанный на Qt научный графический калькулятор
- galculator — Основанный на GTK+ научный калькулятор
- GCalctool — Научный калькулятор, включенный в состав окружения GNOME (версия на GTK2)
- GNOME Calculator — Научный калькулятор, включенный в состав окружения GNOME (новая версия на GTK3)
- KAlgebra — Калькулятор и 3D-плоттер, включенный в состав KDE EDU
- http://www.kde.org/applications/education/kalgebra/ || kdeedu-kalgebra[ссылка недействительна: package not found]
- KCalc — Научный калькулятор, включенный в состав окружения KDE
- http://kde.org/applications/utilities/kcalc/ || kdeutils-kcalc[ссылка недействительна: package not found]
- Qalculate — Калькулятор и "решатель" уравнений с поиском ошибок, распознаванием констант и единиц измерения (units)
- SpeedCrunch — Быстрый и мощный кроссплатформенный калькулятор с высокой точностью
- xcalc — Научный калькулятор для X с поддержкой алгебраического режима и режима обратной польской записи
Системы компьютерной алгебры
Дополнительную информацию смотрите в Википедии: Список систем компьютерной алгебры.
- Fermat — Система компьютерной алгебры, которая выполняет операции с произвольно длинными числами и дробями, многомерными полиномами, символьными вычислениями, матрицами над кольцами многочленов (matrices over polynomial rings) и графиками, а также другие расчеты
- http://home.bway.net/lewis/ || fermatAUR[ссылка недействительна: сохранено в aur-mirror]
- GAP — Система компьютерной алгебры для дискретных вычислений с особым акцентом на вычислительной теории групп
- http://www.gap-system.org || gap-mathAUR[ссылка недействительна: сохранено в aur-mirror]
- Maple — Знаменитая коммерческая СКА. Часто используется в обучающих целях
- http://www.maplesoft.com/products/maple/ || Пакет не существует? искать в AUR
- Mathomatic — Система компьютерной алгебры общего назначения, написанная на C
- Maxima — Программа в стиле Maple/Mathematica с фронтендом, основанным на wxWidgets
- PARI/GP — Система компьютерной алгебры, разработанная для быстрых вычислений в области теории чисел
- Xcas — Пользовательский интерфейс для Giac, свободной, базовой системы компьютерной алгебры
Научные и технические вычисления
Дополнительную информацию смотрите в Википедии: Сравнение программного обеспечения для числового анализа.
- EngLab — Кросс-компилируемая математическая платформа с синтаксисом в стиле C
- Euler — Приложение, разработанное для математики высшего уровня: вычисления, оптимизация и статистика. Использует Maxima для символьных операций
- http://euler.sourceforge.net || eulerAUR[ссылка недействительна: сохранено в aur-mirror]
- FreeMat — Программа в стиле Matlab, поддерживающая многие ее функции, не требующая интерфейса к внешнему коду C, C++ и Fortran, поддерживающая параллельную распределенную разработку алгоритма (через MPI) и возможности 3D-визуализации
- GNU Radio — Тулкит для разработки программного обеспечения, предлагающий блоки обработки сигналов для реализации радиовещания на программном уровне
- PyLab — Коллекция модулей Python (pyplot, numpy и т.д.), используемых для научных вычислений
- Sage — Математическая программа, комбинирующая множество существующих пакетов с открытым исходным кодом в общий интерфейс Python. Является альтернативой Magma, Maple, Mathematica и Matlab
- http://www.sagemath.org || sage-mathematics[ссылка недействительна: сохранено в aur-mirror]
- Scilab — Альтернатива Matlab, используемая для числовых вычислений. Ее синтаксис не такой, как в Matlab, но его можно легко конвертировать
- http://www.scilab.org/ || scilabAUR
Статистика
Дополнительную информацию смотрите в Википедии: Сравнение статистических пакетов.
- JAGS (Just another Gibbs sampler) — Кроссплатформенная программа для анализа иерархических моделей Bayesian с использованием симуляции Markov Chain Monte Carlo (MCMC)
- Python Data Analysis Library (pandas) — Предоставляет высокопроизводительные и легкие в использовании структуры данных и утилиты их анализа при помощи языка программирования Python
- PSPP — Свободная реализация SPSS
- R — Программная среда для статистических вычислений и графиков
- RKWard — Фронтенд к статистическому языку R
- RStudio — Мощная и продуктивная IDE для R, написанная на Qt
Анализ данных
Дополнительную информацию смотрите в Википедии: Список программного обеспечения для построения информационных графиков.
- Extrema — Инструмент визуализации и анализа данных
- http://sourceforge.net/projects/extrema || extremaAUR[ссылка недействительна: сохранено в aur-mirror]
- Fityk — Программа аппроксимации пикоподобными функциями и анализа данных, преимущественно используемая, чтобы соответствовать аналитическим и колокольчиковидным (bell-shaped) функциям
- http://fityk.nieto.pl/ || fitykAUR
- Gnuplot — Консольная программа, способная генерировать 2D- и 3D-графики функций, данных
- Grace — WYSIWYG-инструмент построения 2D-графиков
- http://plasma-gate.weizmann.ac.il/Grace/ || graceAUR qtgraceAUR gracegtkAUR
- LabPlot — Свободная программа анализа данных и визуализации, похожая на SciDAVis
- http://labplot.sourceforge.net/ || labplot2AUR[ссылка недействительна: сохранено в aur-mirror]
- QtiPlot — Не зависящее от платформы приложение для построения интерактивных научных графиков и анализа данных, похожее на проприетарные Origin и SigmaPlot
- http://www.qtiplot.com/ || qtiplot[ссылка недействительна: package not found]
- ROOT — Программа анализа данных и библиотека, разработанные в CERN (изначально для физики элементарных частиц)
- SciDAVis — Форк QtiPlot, созданный с целью быть более документированным и дружелюбным к пользователю
Смотрите также: Электронные таблицы
Химия и биология
Вычислительная биология и биоинформатика
Дополнительную информацию смотрите в Википедии: Список программного обеспечения для биоинформатики с открытым исходным кодом.
- BALL (Biochemical Algorithms Library) — Фреймворк на C++, предоставляющий обширный набор структур данных и классов для молекулярной механики, расширенные методы решения, сравнение и анализ белковых структур, импорт/экспорт файлов и визуализацию
- BioJava — Набор инструментов на Java для вычислительной биологии и биоинформатики
- Biopython — Пакет на Python с инструментами для вычислительной биологии и биоинформатики
- EMBOSS (European Molecular Biology Open Software Suite) — Программа анализа с открытым исходным кодом, специально разработанная для нужд сообщества людей, связанных с молекулярной биологией и биоинформатикой
- MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) — Интегрированный инструмент для проведения автоматического и ручного выравнивания последовательностей, выведения филогенетических деревьев и последовательности предков, поиска баз данных, оценки темпов молекулярной эволюции и тестирования эволюционных гипотез
- http://www.megasoftware.net/ || Пакет не существует? искать в AUR
- MUMmer — Программа биоинформатики для выравнивания последовательностей, основанного на деревьях суффиксов (suffix trees)
- UGENE — Приложение, объединяющее в себе десятки хорошо известных биологических инструментов и алгоритмов и предоставляющее как графический интерфейс, так и интерфейс командной строки
- http://ugene.unipro.ru/ru/ || ugeneAUR[ссылка недействительна: package not found]
Молекулярные структуры
Просмотр
Дополнительную информацию смотрите в Википедии: Список систем молекулярной графики.
- Avogadro — Программа редактирования, просмотра и имитации в 3D молекулярных структур. Поддерживает скачивание файлов из Protein Data Bank
- BALLView — Автономное приложение молекулярного моделирования и визуализации, часть фреймворка BALL
- http://www.ballview.org/ || ballAUR
- Ghemical — Программное обеспечение вычислительной химии, используемое для редактирования, просмотра и имитации молекулярных структур
- PyMOL — Система молекулярной визуализации с открытым исходным кодом, которая может создавать 3D-изображения небольших молекул и биологических макромолекул, таких как протеины, в высоком качестве
- RasMol — Компьютерная программа для графической визуализации молекулярных структур, предназначенная и используемая преимущественно для отображения и исследования структур макромолекул
- http://www.rasmol.org/ || rasmolAUR[ссылка недействительна: сохранено в aur-mirror]
Рисование
- BKChem — Практичная и хорошо выглядящая программа рисования молекул
- Chemtool — Основанная на GTK+ программа рисования химических структурных формул
- EasyChem — Простая программа рисования химических структурных формул с акцентом на создании качественных изображений
- http://easychem.sourceforge.net/ || Пакет не существует? искать в AUR
- Gabedit — Графический пользовательский интерфейс для таких пакетов вычислительной химии, как GAMESS, Gaussian, MOLCAS, MOLPRO, MPQC, OpenMopac, Firefly (прежнее название - PC GAMESS) и Q-Chem
- XDrawChem — "Обширная" программа рисования химических структурных формул (включает в себя прогноз спектроскопии)
Моделирование
- GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations) — Универсальный пакет для изображения молекулярной динамики, например, имитации уравнений движения Ньютона, для систем с тысячами и миллионами частиц
- Quantum ESPRESSO — Интегрированный набор приложений для расчетов электронной структуры и моделирования материалов на наноуровне. Используются теория функционала плотности, плоские волны и псевдопотенциалы (как сохраняющие норму, так и ультрамягкие)
Периодическая таблица элементов
- gElemental — Периодическая таблица элементов с дополнительной информацией
- Kalzium — Периодическая таблица элементов с редактором молекул и "решателем" уравнений из окружения KDE
- http://edu.kde.org/kalzium/ || kdeedu-kalzium[ссылка недействительна: replaced by kalzium]
Биохимия
- Bioclipse — Основанная на Java визуальная платформа для биохимии, использующая Eclipse Rich Client Platform (RCP)
- http://www.bioclipse.net/ || Пакет не существует? искать в AUR
Работа с изображениями
- ImageJ — Основанная на Java программа обработки и анализа изображений, расширяемая при помощи плагинов и макросов. Широко используется в микроскопии (например, для подсчета клеток)
- Fiji — ImageJ (а вскоре ImageJ2), упакованный в один пакет вместе с большим количеством плагинов, организованных в единой структуре меню
- http://fiji.sc || fiji-binaryAUR
Астрономия
- Celestia — Астрономическая программа 3D-имитации, позволяющая пользователям "путешествовать" по обширной вселенной, смоделированной по образцу реальности, на любой скорости, в любом направлении и в любое историческое время
- GIMP Astronomy Plugins — Набор плагинов GIMP для обработки астрономических изображений
- GoQat — Программное обеспечение для камер (в особенности для камер QSI), предоставляющее такие возможности, как сбор (acquisition), автонаведение, помощь при фокусировке и др.
- KStars — Виртуальный планетарий, предоставляющий тщательную графическую имитацию ночного неба из любой точки Земли в любые дату и время. Включен в состав KDE Edu
- http://edu.kde.org/kstars/ || kdeedu-kstars[ссылка недействительна: package not found]
- Open PHD Guiding — Программа автонаведения для телескопов, основанная на знаменитой PHD Guiding
- http://code.google.com/p/open-phd-guiding/ || open-phd-guiding-svnAUR[ссылка недействительна: сохранено в aur-mirror]
- Qastrocam-g2 — Программа сбора (acquisition) планетарных изображений для веб-камер
- Skychart / Cartes du Ciel — Планетарий, предоставляющий изображения и названия объектов большинства созвездий, планет и объектов, которые можно увидеть при помощи телескопа. Имеет возможность скачивания Digitized Sky Survey Charts и изображений superimpose
- StarPlot — Трехмерная карта звездного неба
- http://starplot.org/ || starplotAUR
- Stellarium — Красивый 3D-планетарий, использующий OpenGL для рендеринга реалистичного неба в реальном времени
- XEphem — Основанная на Motif программа с эфемеридой и планетарием
Физика
Электроника
Дополнительную информацию смотрите в Википедии: Сравнение программного обеспечения EDA.
- gEDA — Цельная среда и набор инструментов автоматизации проектирования электронных приборов, используемая для разработки электрических цепей, схем, имитации, создания прототипов и производства
- KiCAD — Программная среда для автоматизации проектирования электронных приборов (EDA), облегчающая создание схем электрических цепей и их конвертацию в PCB (printed circuit board)
- KLogic — Приложение, используемое для легкого создания и имитации электрических цепей
- http://www.a-rostin.de/ || klogicAUR[ссылка недействительна: сохранено в aur-mirror]
- KTechLab — IDE для создания электронных цепей и цепей PIC microcontroller, а также их имитации, предоставляющая обширные возможности с автомаршрутами и имитацией всех общих электронных и логических компонентов
- Oregano — Графическое приложение для создания и имитации электрических цепей. Для имитации используется движок ngspice или Gnucap
- QElectroTech — Приложение, используемое для рисования современных электрических цепей
- Qucs — Приложение имитации электрических цепей, дающее возможность их настройки при помощи графического интерфейса и имитации поведения при длинных сигналах (large-signal), коротких сигналах (small-signal) и шуме
Моделирование физики
- Code_Aster — Программный пакет для строительной инженерии и проектирования
- EPANET — Выполняет моделирование движения воды в большой период времени для труб под давлением
- Step — Движок двумерного моделирования физических процессов, включенный в состав окружения KDE как часть KDE Edu
- http://edu.kde.org/step/ || kdeedu-step[ссылка недействительна: package not found]
- SWMM — Программа количественного и качественного динамического моделирования осадков и стоков, используемая в гидрологии
- http://www.epa.gov/ || swmm5-gitAUR
Конвертация единиц измерения
- ConvertAll — Приложение конвертации единиц измерения, позволяющее совмещать их в любом виде (например, дюймы с декадами), даже если это не имеет смысла
- Gonvert — Утилита конвертации, позволяющая работать с множеством единиц измерения, в том числе CGS, древними, империческими, и содержащая множество категорий, таких как длина, масса, числа и т.д.
- Units — Консольная программа конвертации и калькулятор, способная обрабатывать масштабные мультипликативные и нелинейные преобразования